旋风除尘器靠含尘气流在筒体内旋转完成除尘过程，所以其运行操作和维护管理较其他机械式除尘器重要得多。旋风除尘器的运行包括启动、运行、停车，维护工作主要是常见故障的分析、预防和排除。
1、启动前的检查
1.1检查各单个旋风除尘器是否安装完毕，具备启动条件。无问题后方可启动。
1.2检查每个旋风子安装结合部的气密性：检查除尘器（组）与烟道结合部、除尘器与灰斗结合部、灰斗与排灰装置、输灰装置结合部的气密性。要确保没有足以影响旋风除尘器性能漏灰、漏气现象。
1.3检查完毕后，关小挡板阀，以免通风机过负荷。启动通风机，无异常现象，逐渐开大挡板使除尘器（组）通过规定数量的含尘气体。
2、运行注意事项
2.1注意磨损部位的变化。旋风除尘器最容易被粉尘磨损的部位是与高速含尘气体相碰撞的外筒的内壁。
2.2注意检查气体湿度变化，气体湿度降低时（系统运行或停炉所致），容易造成粉尘的附着、堵塞和腐蚀现象。
2.3注意压差变化和排出烟色状况。因磨损和腐蚀而使旋风除尘器穿孔和导致粉尘排放，于是效率下降，排除烟色恶化，压差发生变化。
2.4注意检查旋风除尘器各连接部位的气密性，检查各单元旋风筒气体流量和集尘浓度的变化。
3、停车
为了防止粉尘的附着或腐蚀，在系统停止运行之后，应继续旋风除尘器运行一段时间，直到器内被空气置换以后方可停止除尘器的运行。为了保证旋风除尘器的正常运行和技术性能，在停运时必须进行下列的检查：
3.1消除内筒、外筒和叶片上附着的粉尘，清除和灰斗内规程的粉尘；
3.2修补磨损和腐蚀引起的穿孔，并将修补处打磨光滑；
3.3检查各结合部位的气密性，必要时更换密封件。
